基于全基因组分析中国PRRSV-1遗传多样性及其进化趋势

2025年7月11日09:21:33科研进展12阅读模式

猪繁殖与呼吸综合征（PRRS）对中国养猪业构成严重威胁。病原PRRSV可分为PRRSV-1型和PRRSV-2型。最近的研究表明，PRRSV-1的检出率有所增加，并且PRRSV-1的分布范围更广。然而，中国的PRRSV-1基因组尚未完全确定。本研究收集了来自不同猪场的24个PRRSV-1全基因组，并进行了全基因组分析。基于全基因组和ORF5序列的系统发育分析表明，来自中国的PRRSV-1株属于西欧I亚型，可分为7个亚群。统计分析显示，bjeu06 -1样PRRSV是目前主要的PRRSV-1毒株。此外，相似性分析显示，来自不同猪场的大多数PRRSV-1基因组之间的配对相似性较低。Nsp2基因的氨基酸序列显示BJEU06-1-Like小组有5个中断aa删除(4 + 1)。HKEU16-Like亚群有5个不连续的aa缺失（1 + 4）。重组分析显示BJEU06-1-Like和NMEU09-1-Like菌株广泛参与了近期的重组事件。因此，加强中国PRRSV-1的流行病学调查，特别是对bjeu06 -1样PRRSV的监测至关重要。